Микроскоп, предназначенный для получения кросс-секциональных [трехмерных (3-D)] изображений с высоким увеличением путем сканирования образца сфокусированной точкой лазерного излучения, ограничивая освещение маленьким целевым участком образца и устраняя расфокусированный свет (конфокальная микроскопия). Данные изображений регистрируются, увеличиваются и, как правило, оцифровываются и выводятся на монитор с высоким разрешением (обычно 1024 х 1024 пикселей). Данные могут сохраняться, например, в компьютере. Этот микроскоп может быть установлен на обычном или специально разработанном световом микроскопе, например, на вертикальном или перевернутом штативе, и используется главным образом для исследований в области цитологии и молекулярной биологии, например, для изучения клеток, клеточных культур или тканей.